邵阳市妇幼保健院的前身是邵阳市妇幼保健所，创立初期仅有5名妇幼保健人员，主要职责为在市区范围内推广新法接生并开展相关宣传，同时承担接生员的培训与管理任务。自1958年开始，机构历经数次重要整合与发展：1986年，原地区与市妇幼保健站（所）合并，正式成立邵阳市妇幼保健所；1994年，机构升格为副处级事业单位，并更名为邵阳市妇幼保健院；2016年，与全市计划生育技术服务职能整合，增挂“邵阳市妇幼保健计划生育服务中心”牌子；2019年，再度加挂“邵阳市妇女儿童医院”牌子；至2022年，成功获批成为三级妇幼保健院。