医院始建于1953年5月，是由政府举办、具有公共卫生性质的非营利性公益一类全额拨款卫生事业单位，集预防、保健、医疗、康复、急救、科研、教学七位于一体，属三级妇幼保健机构。前身为邵阳市妇幼保健所（1986年由地、市妇幼保健站（所）合并而来），1994年升格为副处级事业单位，改称邵阳市妇幼保健院。2016年与全市计划生育服务职能合并，加挂了“邵阳市妇幼保健计划生育服务中心”牌子，2019年加挂“邵阳市妇女儿童医院”牌子，2022年被批准为三级妇幼保健院。目前是湖南省妇幼保健院、湖南省儿童医院和湖南中医药大学第一附属医院的医联体单位，与广东省妇幼保健院建立生殖健康与不孕症专科联盟，与双清区渡头桥镇卫生院建立医联体。

2024年，医院新综合大楼已部分投入使用，编制床位数由110张增加至400张（2020年经市卫健委批复同意增加到400张），业务用房面积由8395㎡增加至27429㎡。共有编制床位110张，开放床位71张，硬件设施完善。目前设立全市产前筛查中心、产前诊断中心、新生儿疾病筛查中心、出生缺陷防控和质量控制中心、两癌筛查管理及质量控制中心和婴幼儿照护服务指导中心。设置孕产保健部、妇女保健部、儿童保健部。现开设儿科、新生儿科、儿童保健科、儿童康复科、盆底及产后康复科、产科、妇科、乳甲科、麻醉科、中医科、急诊科、医学遗传科、生殖医学科、手术室、检验科、病理科、影像科、药剂科等临床和医技科室。坚持“母亲安全，儿童优先”的宗旨，作为全市妇幼保健业务指导中心，承担全市12个县（市、区）的妇女儿童医疗、保健、健康教育、培训、妇幼卫生信息、科研、教学任务，妇幼危重症救治网络覆盖全市。

医院现有职工312人，含卫生专业技术人员276人，其中具有高级职称45人，中级职称101人；本科学历以上207人（其中硕士研究生4人）。医院正积极适应发展新常态，紧抓发展机遇，从建筑装备硬件设施、技术人才软件环境、核心技术研发等方面努力打造一流市级妇幼保健院。

近年来，医院接连荣获湖南省降低孕产妇死亡先进单位、湖南省艾滋病抗体检测实验室质量考评优秀单位、湖南省维护妇女儿童权益先进集体、湖南省最受残疾人欢迎康复医疗机构、湖南省出生缺陷防治工作先进单位、湖南省妇幼保健机构标准化建设工作先进单位、邵阳市巾帼文明岗等荣誉称号、市级清廉医院样本培树点，荣获2023年度邵阳市卫生健康系统宣传工作网络影响力“优秀单位”。